Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms