Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms