Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms