Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFWD3Q6PCD5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms