Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD40Q6AI12 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms