Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMPD1Q5SYB0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms