Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGO1Q5FBB7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGO1Q5FBB7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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