Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms