Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms