Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTXN3Q4LDR2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTXN3Q4LDR2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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