Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms