Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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