Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RTL8BQ17RB0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms