Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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NDUFA9Q16795 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NDUFA9Q16795 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NDUFA9Q16795 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NDUFA9Q16795 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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NDUFA9Q16795 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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NDUFA9Q16795 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NDUFA9Q16795 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NDUFA9Q16795 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NDUFA9Q16795 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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NDUFA9Q16795 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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