Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDKN3Q16667 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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