Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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