Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SS18Q15532 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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