Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms