Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB35Q15286 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms