Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PCM1Q15154 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms