Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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