Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL4A6Q14031 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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