Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GTF2H3Q13889 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms