Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TUBA3CQ13748 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TUBA3CQ13748 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TUBA3CQ13748 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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