Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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TCIRG1Q13488 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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