Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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