Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NR5A1Q13285 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms