Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CALCOCO2Q13137 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CALCOCO2Q13137 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CALCOCO2Q13137 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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