Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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IFT88Q13099 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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IFT88Q13099 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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IFT88Q13099 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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IFT88Q13099 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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IFT88Q13099 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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IFT88Q13099 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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