Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ACACAQ13085 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ACACAQ13085 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ACACAQ13085 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ACACAQ13085 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ACACAQ13085 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ACACAQ13085 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ACACAQ13085 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACACAQ13085 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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