Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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EFEMP1Q12805 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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EFEMP1Q12805 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFEMP1Q12805 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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