Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms