Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZBED6P86452 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms