Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COG7P83436 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COG7P83436 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COG7P83436 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG7P83436 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms