Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-24P63145 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms