Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms