Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCA4P51532 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms