Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMAN1P49257 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMAN1P49257 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms