Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ME1P48163 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ME1P48163 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ME1P48163 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ME1P48163 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ME1P48163 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ME1P48163 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ME1P48163 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms