Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTHFRP42898 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms