Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms