Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMPOP42166 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMPOP42166 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms