Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GGCXP38435 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms