Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNAP12004 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNAP12004 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNAP12004 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNAP12004 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCNAP12004 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PCNAP12004 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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