Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms