Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAVP06756 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms