Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms