Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBXN8O00124 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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