Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SMIM1B2RUZ4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms