Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CFAP73A6NFT4 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms